化学熏蒸剂是防治土传病害较为有效的药剂。

长期以来，化学熏蒸剂发展较慢，一些有效的药剂，由于环境或健康问题很难获得农药登记，且商业化的古老品种如氯化苦在我国因为高毒也面临被淘汰的局面。寻找环境友好型的熏蒸剂一直是农药界研究的重点。据中国农业科学院植物保护研究所曹坳程等专家介绍，目前来看，具有良好发展前景的熏蒸剂主要有异硫氰酸烯丙酯、二甲基二硫、乙二腈和乙蒜素等4种。

异硫氰酸烯丙酯（AITC）。AITC是一种天然产物。2013年美国国家环境保护局批准登记AITC为种植前土壤处理剂，是第一款可同时用于传统及有机耕种的生物土壤熏蒸剂。我国已将其登记用于防治番茄根结线虫和草莓根腐病。

二甲基二硫（DMDS）。DMDS已在许多国家登记注册用于作物种植前进行土壤熏蒸，是一种新型的生物源土壤熏蒸剂，该熏蒸剂对根结线虫和杂草的防治效果与1,3-二氯丙烯（1,3-D）相当甚至优于1,3-D。DMDS对臭氧层的破坏风险较小，同时具有高效、环境安全的特性，被联合国溴甲烷技术选择委员会列为最有潜力的替代品。

乙二腈（EDN）。澳大利亚联邦科学与工业研究组织通过室内与温室试验表明EDN作为土壤熏蒸剂有望替代溴甲烷。EDN对植物寄生线虫和杂草等土传病原物具有抑制作用。EDN具有与溴甲烷相似的化学性质，可在土壤剖面中轻易移动。2018年，澳大利亚成为第一个批准在草莓、果树、葫芦和观赏植物上使用EDN的国家。EDN也已在韩国注册，并将在土耳其、南非、加拿大、美国、俄罗斯、新西兰和马来西亚等国家注册登记。

乙蒜素。乙蒜素是我国20世纪60年代研制的一种有机硫杀菌剂。据报道，乙蒜素也具有熏蒸作用，可防治一些植物病原体和线虫。我国已将其登记用于防治棉花枯萎病、黄萎病、立枯病，水稻烂秧病、恶苗病、纹枯病，黄瓜枯萎病及甘薯黑斑病等土传病害。