1962年，美国大祥公司（Diamond Shamrock Co.）发现了百菌清，并于20世纪70年代先后建立了两套3,000t/a的生产装置，所以百菌清也是一个拥有50年历史老产品。目前，美国、日本、意大利和韩国等均有百菌清生产，国外生产企业包括先正达、意大利的Vischim公司和日本的SDS生物技术公司等。20世纪80年代初，我国云南省化工研究所开始研究百菌清，1984年原化学工业部主持并通过了技术鉴定和基础设计的审查，并于1989年建立了100吨/年百菌清（96%）生产中试装置，从此开始了百菌清在国内的生产。
 

百菌清是一个保护性的杀菌剂，不像其它治疗性杀菌剂那样容易产生抗药性，它的市场相对比较稳定，不会有大的波动。2011年，百菌清全球销售额同比增长8.8%，达到3.1亿美元，主要分布在美国、日本、法国和巴西等4个高端市场，这4个市场占整个市场50%以上的份额。百菌清主要用于经济类作物，如蔬菜、水果、马铃薯等，其次用于大宗作物，如谷物和水稻等；工业上也用作涂料、电器、皮革、纸张和布料等的防霉剂。百菌清全球的需求总量约为2万吨（原药）。而同行业的产能已超过3万吨，其中主要的生产企业是先正达，其产能为9,000吨；国内企业目前的产能也已达到了2.5万吨，而国内的市场需求量仅为3,000吨制剂（折合原药为2,000吨）左右，因而国内企业的产能主要还是依靠出口来释放。2011年全年总出口量约1.35万吨，其中原药占80%，在1.1万吨左右，制剂不足3,000吨。2012年1～7月，百菌清出口量为约为9,000吨，其中原药为6,000多吨，制剂仅为2,000多吨（折百）。据中国农药工业协会统计，2012年1-10月累计产量8651.26 吨（折百量），累计销售7965.99吨。

 2010年中期，大的百菌清生产企业只有3家，分别为江苏新河农用化工有限公司、江阴苏利化学有限公司和山东大成农药股份有限公司，非法生产企业较多。

 
从2011年开始，百菌清的价格竞争比较激烈，价格一路走低，主要原因是，国内一些非法企业在用小装置进行生产，导致一是把价格拉下来，二是市场上出现了非法竞争。但要生产好的百菌清，需要有连续化装置，才能取得稳定的产量和质量。 由于百菌清的原材料受石油价格的影响很大，导致生产成本增加；另一方面百菌清的价格在下滑，目前稳定在2.6万元左右。但同时也有有利因素，当前国内百菌清扩产的趋势得到控制，预计价格将会上涨，市场将走出低迷态势。